火影忍者手游想要正常使用密卷，需要先完成系统解锁、碎片合成、提前装备三个前置步骤，对局内点击密卷图标就能释放技能，同时还要掌握冷却、金刚体、专属变化等实战规则才能把密卷效果完全发挥出来。账号等级到达30级之后密卷功能正式开启，但是解锁系统不等于直接拥有可用的密卷，每一款密卷都需要集齐对应数量的碎片进行合成激活，没有激活的密卷无法装备上场。碎片主要产出途径是小队突袭，开启三倍奖励可以加快碎片收集速度，决斗场奖励、各类活动礼包、商城限购道具也可以用来补齐缺少的碎片，稀有密卷则需要通过忍法帖或者积分商店进行兑换获取。激活后的密卷需要提前配置，打开主界面的密卷板块，选中一款已经解锁的密卷装备到忍者身上，每名忍者一次只能携带一个密卷，更换忍者或者调整密卷都需要在战斗开始前完成，已经进入对局之后不能临时切换密卷。
进入实战对局之后，屏幕右下角技能区域会出现已经装备好的密卷按钮，按钮上方的数字代表剩余冷却时间，数字归零图标亮起之后就可以随时点击释放密卷技能，释放之后密卷立刻进入新一轮冷却周期，冷却时长会根据密卷种类和等级产生变化。释放密卷的瞬间忍者会短暂获得金刚体状态，这个状态可以顶住敌人大部分非抓取类的技能攻击，熟练利用这个机制可以在被对手突进的时候反手释放密卷，规避伤害同时完成反击，这也是决斗场十分核心的对战技巧。部分忍者还有专属密卷效果，普通密卷被指定忍者携带之后技能形态、伤害、附加buff都会发生改变，部分密卷还支持搭配摇杆方向释放多种分支效果，使用这类忍者之前需要提前熟悉专属密卷的改动机制，避免实战里释放出错误的技能形态。
密卷的等级同样会直接影响实战手感，密卷升到十级之后技能的核心效果，像是控制时长、吸附范围、霸体持续时间就已经全部解锁，后续继续升级只会增加战力属性，不会改动技能本身的实战强度，资源有限的情况下优先把常用密卷升到十级性价比最高。不同类型的密卷有着完全不一样的使用思路，风杀阵、气旋这类范围控制密卷，可以用来远距离起手、逼迫对手走位；霸体、解术散偏向反手自保，适合被近身压制的时候用来挣脱劣势局面；查克拉密卷可以补充奥义点数，方便快速开出大招完成爆发输出，玩家要根据忍者短板以及常遇到的对手阵容灵活挑选适配密卷。对局之中也不要随意空放密卷，密卷冷却普遍较长，一旦过早交出密卷，接下来很长一段时间都会缺少关键的反手手段，尽量留到需要起手、顶技能或者打断连招的时候再进行释放。
